卡氏肺囊蟲肺炎的癥狀與細(xì)菌性肺炎、病毒性肺炎和真菌性肺炎類似，必須加以鑒別。一般來說，卡氏肺囊蟲肺炎的癥狀有所分類，分為嬰兒型和兒童型兩類。

A.嬰兒型：主要發(fā)生在1～6個(gè)月小嬰兒，屬間質(zhì)性漿細(xì)胞肺炎，起病緩慢，主要癥狀為吃奶不好、煩躁不安、咳嗽、呼吸增快及發(fā)紺，而發(fā)熱不顯著。聽診時(shí)啰音不多，1～2周內(nèi)呼吸困難逐漸加重。肺部體征少，與呼吸窘迫癥狀的嚴(yán)重程度不成比例，為本病特點(diǎn)之一。病程4～6周，如不治療約25%～50%患兒死亡；

B.兒童型：主要發(fā)生于各種原因所致免疫功能低下者，起病急驟，與嬰兒型不同處為幾乎所有病人均有發(fā)熱。此外，常見癥狀為呼吸加速、咳嗽、發(fā)紺、三凹征、鼻扇及腹瀉。病程發(fā)展很快，不治療時(shí)多死亡。